- 颂赞曲,BWV1-BWV224
- 大型合唱宗教作品,BWV225-BWV249
- 众赞歌和宗教歌曲,BWV250-BWV524
- 管风琴音乐,BWV525-BWV748
- 键盘音乐,BWV772-BWV994
- 鲁特琴音乐,BWV995-BWV1000
- 室内乐,BWV1001-40
- 管弦乐,BWV1041-71
- 卡农和赋格曲(散),BWV1072-BWV1126
- 较着名的作品
- 勃兰登堡协奏曲,BWV1046-BWV1051
- 小提琴协奏曲,BWV1041-BWV1043
- 德国组曲,BWV825-BWV830
- 十二平均律键盘曲集,BWV846-BWV893
- B小调弥撒,BWV232
- 马太受难曲,BWV244
- 约翰受难曲,BWV245
- 管弦乐组曲/乐队组曲,BWV1066-BWV1069
- 哥德堡变奏曲,BWV988
- 无伴奏大提琴组曲,BWV1007-BWV1012
- 无伴奏小提琴奏鸣曲与组曲,BWV1001-BWV1006
- 音乐的奉献,BWV1079
- 赋格的艺术,BWV1080
- G弦上的咏叹调,原为BWV1068管弦乐组曲第三号SuiteNo.3inDmajor的第三乐章改编而成
- E大调小提琴协奏曲,BWV1042
他的作品包括有将近300首的大合唱曲;组成《平均律钢琴曲集》的一套48首赋格曲和前奏曲;至少还有140首其它前奏曲;100多首其它大键琴乐曲;23首小协奏曲;4首序曲;33首奏鸣曲;5首弥撒曲;3首圣乐曲及许多其它乐曲。总计起来,巴赫谱写出800多首严肃乐曲。