专着
《春草集》（戏曲研究论文集，上海文艺出版社，1979年10月）
《逝川集》（文学史研究文集，陕西人民出版社，1980年5月）《脂砚斋重评石头记》（己卯本）（中国青年出版社，1980年6月）
冯其庸作品
《梦边集》（红楼梦研究论文集，陕西人民出版社，1982年10月）
《秋风集》（散文序跋集，文化艺术出版社，1990年3月）
《落叶集》（学术随笔，北京社会科学出版社，1997年3月）
《曹学叙论》（曹学研究专着，光明日报出版社，1992年）
《漱石集》（红楼梦研究论文二集，湖南岳麓书社，1992年）
《论庚辰本》（红学版本研究专着，上海文艺出版社出版，1978年4月）
《〈石头记〉脂本研究》（红楼梦版本研究专着，人民文学出版社，1998年12月）
《曹雪芹家世新考》（曹雪芹研究专着，上海古籍出版社，1980年7月）
《八家评批红楼梦》（红楼梦评点派研究，文化艺术出版社，1991年9月）
《增订本曹雪芹家世新考》（曹雪芹研究专着，文化艺术出版社，1997年7月）
《曹雪芹家世·红楼梦文物图录》（红学研究专着，图版732幅，考证文字五万字，香港三联书店，1983年12月）
《夜雨集》（学术散文随笔，北京友谊出版公司，1999年2月）
《瀚海劫尘》（中国大西部摄影集，共图229幅，文化艺术出版社，1995年1月）
《蒋鹿谭年谱·水云楼诗词辑校》（词学专着，齐鲁书社，1986年9月）
《评批〈书剑恩仇录〉》（文化艺术出版社，1998年11月）
《评批〈笑傲江湖〉》（文化艺术出版社，1998年11月）
《瓜饭楼重校评批〈红楼梦〉》（辽宁人民出版社，2005年1月）
《敝帚集：冯其庸论红楼梦》（文化艺术出版社，2005年2月）
合着
《朱屺瞻年谱》（当代中国画家研究，与尹光华合着，上海书画出版社，1986年5月）
《脂砚斋重评石头记汇校》（与冯统一合作，用12种脂本石头记排列汇校，七年始完稿，文化艺术出版社，1989年4月）
《吴梅村年谱》（清诗研究专着，与叶君远合着，江苏古籍出版社，1990年3月）
《红楼梦概论》（与李广柏合着，北京图书馆出版社，2004年3月）
主编
《历代文选》（古代散文选读，中国青年出版社，1962年9月）
《新校注本红楼梦》（红楼梦读本，人民文学出版社，1982年5月）
《红楼梦大辞典》（文化艺术出版社，1990年）
《曹雪芹墓石论争集》（文化艺术出版社，1994年8月）
《中华艺术百科大辞典》（商务印书馆，1998-1999年）
论文
《五庆堂重修辽东曹氏宗谱》考略（《红楼梦学刊》1979年01期）
论《脂砚斋重评石头记》甲戌本'凡例'（《社会科学战线》1979年02期）
二百年来的一次重大发现——关于曹雪芹的书箧及其他（《红楼梦学刊》1980年01期）
醉里乾坤大——论《红楼梦》的情节和细节描写（《社会科学辑刊》1981年02期）
关于己卯本的影印问题及其他（《社会科学战线》1981年03期）
影印《脂砚斋重评石头记》甲戌本上被胡适删去的几条跋文（《红楼梦学刊》1982年03期）
论南戏《张协状元》与《琵琶记》的关系兼论其产生的时代（《社会科学战线》1984年02期）
瞿塘石歌（《清明》1985年03期）
关于中国的陶文化、茶文化及其他（《文艺研究》1990年01期）
曹学叙论（《红楼梦学刊》1991年04期，1992年01期，1992年02期）
一个持续五千年的文化现象——良渚玉器上神人兽面图形的内涵及其衍变（《中国文化》1991年02期）
论程甲本问世的历史意义——为纪念程甲本问世二百周年而作（《红楼梦学刊》1992年03期）
曹雪芹墓石目见记（《红楼梦学刊》1992年04期）
论《红楼梦》的脂本、程本及其他——为马来西亚国际汉学会议而作（《红楼梦学刊》1994年02期）
再论曹雪芹的家世、祖籍和《红楼梦》的着作权（《红楼梦学刊》1995年01期）
曹雪芹祖籍'丰润说'驳论（《红楼梦学刊》1996年03期)
玄奘取经东归入境古道考实——帕米尔高原明铁盖山口考察记（《法音》1999年03期）
关于北京师范大学藏《石头记》庚辰抄本的几点思考（《红楼梦学刊》2001年04期）
论《红楼梦》的思想（《红楼梦学刊》2002年01期）
启功先生论《红》发微——论《红楼梦》里的诗与人（《北京师范大学学报：人文社会科学版》2002年03期）
曹雪芹的祖籍、家世和《红楼梦》的关系——对一个争论了半个多世纪的问题的梳理和透视（《红楼梦学刊》2002年04期）
冯先生在采风
《红楼梦》的思想（央视百家讲坛，2003年10月15日）
解读《红楼梦》（《红楼梦学刊》2004年02期）
初读《四松堂集》付刻底本——重论曹雪芹卒于'壬午除夕'（《红楼梦学刊》2006年04期）
读沪上新发现的残脂本《红楼梦》（《红楼梦学刊》2006年06期）
曹、李两家的败落和《红楼梦》的诞生（《红楼梦学刊》2007年03期）
《红楼梦》的语言魅力（《文汇报》2007年4月6日）
书评
天末怀海翁——为沈祖安兄所记刘海粟《存天阁谈艺录》一书而作（《清明》1989年02期）
快读《红楼梦》王蒙评（《红楼梦学刊》1995年04期）
缜密考证精微析论——读《曹雪芹江南家世丛考》（《红楼梦学刊》2000年03期）
《敦煌吐鲁番学论稿》书后（《江苏社会科学》2000年04期）
乡邦要籍 史学精品──读'江苏地方文献丛书'（《中国图书评论》2000年06期）
万颗珍珠一线穿——读丁维忠《红楼探佚》书感（《红楼梦学刊》2007年01期）
序跋
《红楼梦新论》序（《读书》1982年09期）
《红楼识小录》序（《陕西理工学院学报：社会科学版》1983年02期）
《红楼梦论集》序（《红楼梦学刊》1984年01期）
《精忠旗笺证》序（《陕西理工学院学报：社会科学版》1984年02期）
论侯北人的画——侯北人画集序（《陕西理工学院学报：社会科学版》1984年03期）
读书·游山·看画——《历代游记选》序（《陕西理工学院学报：社会科学版》1985年01期）
读屺瞻老人的画——屺瞻老人画册序（《社会科学战线》1985年01期）
吴梅村年谱序（《苏州大学学报：哲学社会科学版》1986年03期）
重议评点派——《八家评批红楼梦》序（《红楼梦学刊》1987年01期）
《脂砚斋重评石头记汇校》序（《红楼梦学刊》1987年03期）
走自己的路——王同书《施耐庵研究论集》序（《社会科学战线》1987年03期）
振衣千仞冈濯足大江流——为《傅抱石画集》而作（《文艺研究》1989年01期）
《新编石头记脂砚斋评语辑校》序（《红楼梦学刊》1989年01期）
《金瓶梅及小说戏曲比较研究》序（《徐州师范大学学报：哲学社会科学版》1989年01期）
论梦叙本——影印梦觉主人序本《红楼梦》序（《红楼梦学刊》1989年02期）
《红楼梦大辞典》序（《红楼梦学刊》1989年02期）
校红漫议——八家评批红楼梦校后记（《红楼梦学刊》1989年04期）
《红楼梦研究》序（《红楼梦学刊》1991年02期）
语可诲人光可鉴物——《俞平伯·周颖南通信集》叙（《中国文化》1991年02期）
《红楼梦会心录》叙（《红楼梦学刊》1992年02期）
无尽的怀念——《漱石集》后记（《红楼梦学刊》1992年04期）
重论庚辰本——《校订庚辰本脂评汇校》序（《红楼梦学刊》1993年01期）
关于《石头记》脂本的研究——《〈石头记〉脂本研究》序（《红楼梦学刊》1998年01期）
红学的新贡献——《红楼梦考论》序（《红楼梦学刊》1998年04期）
笔耕不辍的艺术大师——《朱屺瞻作品集—朱屺瞻艺术馆藏品》序（《美术之友》2000年01期）
读红三要——胥惠民《和青年朋友谈〈红楼梦〉》序（《红楼梦学刊》2001年04期）
《论〈红楼梦〉的思想》自序（《红楼梦学刊》2002年01期）
《清代评点本红楼梦丛书》序（《红楼梦学刊》2002年03期）
《红楼楼》——永恒的认识对象——《红楼梦六人谈》序（《红楼梦学刊》2003年03期）
红楼沉思录——《曹雪芹的最后十年考》序（《红楼梦学刊》2003年04期）
永远芬芳的红学奇葩——《红楼梦人物论》序（《河南教育学院学报：哲学社会科学版》2004年01期）
论甲戌本——纪念曹雪芹逝世240周年重印《脂砚斋重评石头记》甲戌本弁言（《红楼梦学刊》2004年04期）
我对《红楼梦》的解悟——瓜饭楼重校《评批〈红楼梦〉》后序（《河南教育学院学报：哲学社会科学版》2004年06期）
《红楼梦与扬州》序——从'富贵荣华'到'茫茫白地'（《红楼梦学刊》2007年01期）
杂文
千古文章未尽才——为纪念曹雪芹逝世二百二十周年而作（《红楼梦学刊》1983年04期）
列宁格勒藏抄本《石头记》印象（《红楼梦学刊》1985年03期）
怀念叶圣陶老人（《红楼梦学刊》1989年01期）
瓜饭楼上说金庸（《读书》1991年12期）
汉画漫议（《寻根》1995年05期）
曹雪芹和《红楼梦》（《红楼梦学刊》1999年03期）
千秋长怀赵朴翁（《佛教文化》2000年Z1期）
彩笔昔曾干气象白头吟望苦低垂
——为柳子谷先生诞辰一百周年作（《同泽书画》，2001年10月16日）
庄生晓梦迷蝴蝶——读杜世禄画的感受（《艺术界》2002年01期）
列宁格勒藏本《石头记》回归记——我与中华书局（《红楼梦学刊》2003年01期）
乾坤清气一鸿儒——饶宗颐的书画艺术（《中国书画》2004年09期）
丹青泼向黔西东——读刘白云先生的山水画（《美术观察》2004年10期）
我的《红楼梦》研究——2004年9月21日在新疆师范大学的学术演讲（《新疆师范大学学报：哲学社会科学版》2005年01期）
学画漫忆（《荣宝斋》2005年02期）
又见青山育后人——读俞宏理山水画（《书画艺术》2005年04期）
两桩历史事实和两件珍贵文献（《紫禁城》2005年06期）
关于王瑗仲先生的绝笔《十八帖》（《中国书画》2005年07期）
石壶手稿（《艺术界》2006年03期）
传统书画的学习和继承——写在我的书画展之前（《文艺研究》2006年05期）
怀旧空吟闻笛赋——《红楼梦》新校注本25周年纪念座谈会上的发言（《红楼梦学刊》2007年02期
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