- 缪荃孙 （1910.5-1911）
- 江翰 （1912.5-1913.2）
- 夏曾佑 （1913-1918）
- 袁希涛 （1918.1-1918.12）
- 傅岳棻 （1919.1-1920.8）
- 王章祜 （1920.8-1921.7）
- 马邻翼 （1921.7-1921.12）
- 陈垣 （1921.12-1922.6）
- 全绍清 （1922.6-1922.7）
- 马叙伦 （1922.10-1922.12）
- 张国淦 （1922.12-1924.3）
- 傅岳棻 （1924.4-1924.10）
- 马叙伦 （1924.11-1925.3）
- 吕复 （1925.3-1925.8）
- 陈任中 （1925.8-1925.12）
- 梁启超 （1925.12-1927.6）
- 郭宗熙 （1927.8-1928.5）
- 马叙伦 （1929.4-1929.8）
- 蔡元培 （1929.8-1940.3）
- 袁同礼 （1943-1948.12）
- 冯仲云 （1953.4-1954.9）
- 丁西林 （1954-1973）
- 刘季平 （1973.11-1981.2）
- 任继愈 （1987.5-2005.1）
- 任继愈 （名誉馆长，2005.1-2009.7）
- 詹福瑞 （2005.1-2009.12）
- 周和平 （2009.12-现在）
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